「候鸟e人」的故事主轴,围绕着一群关心候鸟生态的年轻人,描写一段从舄湖湿地展开的浪漫爱情,「候鸟e人」的情节就像不同季节候鸟的飞翔路径,从七股到关渡,从马祖无人小岛来到时尚现代的台北街头。小青、邵韩和湘子,三个频率接近,彼此互为同伴。却不得不在讲求唯一的爱情里,面对着得到与市区的角色。鸟人和黑琵在网路里相遇,也在现实生活里交会。邵韩和小青在到七股赏鸟的途中,两人因擦撞而结识。彼此剑拔弩张,邵韩的好友小汪同时也爱上了小青。等到两人终于在现实世界中相识,爱情与友情的取舍,该如何是好!而邵韩以为死去的初恋女友湘子,其实还在人世,过往的真情、愧疚与责任,新欢与旧爱之间的挣扎,更令他手足无措。至情至性的他,该如何抉择?偷偷爱着小汪的丁丁,痴痴守候着丁丁的小谢,又会发展出怎样的情节?
劭韩等不愿将“I code”所有权转让,镜白体谅年轻人的热情与冲劲而答应他们的要求。婉姨将日前整理的照片交给小青,顺便聊起小青父亲的往事,婉姨感触良多,告诉小青人与人相爱是一种缘份,如果错过就必须接受后果。小汪担心小青状况,随时去电关心,让小青倍感温馨,丁丁巧遇小青,两人一见如故,小青表示自己并非小汪女友,丁丁暗自松了一口气。劭韩忧心丁丁将来会让情伤,力劝丁丁克制对小汪的情感。